O nó de proteína mais complexo com sete cruzamentos (esquerda) previsto pelo AlphaFold e uma representação simplificada (direita). Crédito: Maarten Brems A questão de como a composição química de uma proteína – a sequência de aminoácidos – determina sua estrutura 3D tem sido um dos maiores desafios da biofísica por mais de meio século. Esse …
Continue lendo “Físicos usam IA para encontrar os nós de proteínas mais complexos até agora”
Detalhe de uma ilustração de Genyornis sendo perseguido de seu ninho por um lagarto Megalania na Austrália pré-histórica. Crédito: Ilustração fornecida pelo artista Peter Trusler. Pesquisadores resolvem um debate acirrado em torno das espécies de “pássaros do trovão” e se seus ovos foram explorados pelos primeiros povos australianos há cerca de 50.000 anos. Proteínas extraídas …
Continue lendo “Proteínas antigas mostram que os primeiros australianos comeram ovos gigantes de enormes pássaros que não voavam”
Os químicos do MIT usaram a espectroscopia de ressonância magnética nuclear (RMN) para revelar como duas formas diferentes da proteína Tau se misturam para formar os emaranhados vistos nos cérebros dos pacientes de Alzheimer. Crédito: Aurelio Dregni/Nadia El-Mammeri/Hong Lab no MIT Dois tipos de proteínas tau se misturam de maneira quase aleatória para gerar os …
Continue lendo “Químicos revelam como as proteínas Tau formam os emaranhados cerebrais da doença de Alzheimer”
Células coradas com FPTs coloridas para mostrar as temperaturas. (Universidade de Cambridge) A doença de Alzheimer é a causa mais comum de demência; se quisermos aliviar seu impacto, precisamos entender o máximo possível sobre como ela começa e os efeitos que tem nas células cerebrais – e um novo estudo revela que o desenvolvimento da …
Continue lendo “Proteínas envolvidas na doença de Alzheimer podem ‘cozinhar demais’ as células através do calor, segundo estudo”
Imagem via Unsplash A quantidade de sal e água em nossas células e seu pH são estritamente controlados para a sobrevivência das células. Para manter o equilíbrio necessário, proteínas especiais desempenham o papel essencial de trocar prótons (íons de hidrogênio, ou H+) por íons de sódio (Na+) ou lítio (Li+) através das membranas celulares. Essas …
Continue lendo “Principais insights sobre uma proteína ligada ao diabetes e à hipertensão”
Informações funcionais complexas ocultas em padrões de sequência de aminoácidos são aprendidas automaticamente por modelos de aprendizado profundo em larga escala e autossupervisionados Crédito: Unsal et al Modelos de linguagem baseados em aprendizado profundo, como BERT, T5, XLNet e GPT, são promissores para analisar fala e textos. Nos últimos anos, no entanto, eles também têm …
Continue lendo “Estudo avalia modelos de deep learning que decodificam as propriedades funcionais de proteínas”
Uma visão de cima para baixo do complexo de poros nucleares humanos, a maior máquina molecular em células humanas. Crédito: Agnieszka Obarska-Kosinska O software DeepMind que pode prever a forma 3D das proteínas já está mudando a biologia. Por mais de uma década, o biólogo molecular Martin Beck e seus colegas vêm tentando montar um …
Continue lendo “O que vem a seguir para AlphaFold e a revolução de dobramento de proteínas de IA”
Rede de Co-Expressão de Proteínas TMT AD. (AC) 516 tecidos do córtex pré-frontal dorsolateral (DLPFC) do Religious Orders Study and Memory and Aging Project (ROSMAP, n=84 controle, 148 AsymAD, 108 AD) e Banner Sun Health Brain Bank (Banner, n=26 controle, 58 AsymAD, 92 AD) foram analisados por proteômica baseada em espectrometria de massa de etiqueta …
Continue lendo “Estudo revela novas alterações relacionadas a proteínas no cérebro de pacientes com doença de Alzheimer”
Ilustração do colapso de proteína mediado por GroEL. Crédito: Mario Avellaneda e Sander Tans Seguindo uma única proteína dentro da cavidade de uma chaperona GroEL pela primeira vez, pesquisadores da AMOLF liderados pelo professor Sander Tans descobriram como o dobramento de proteínas pode ser acelerado. As cadeias de aminoácidos são puxadas para dentro da cavidade …
Continue lendo “Usando manipulação integrada e imagem para estudar o dobramento acelerado de proteínas”
Imagem via Unsplash Vários fatores desempenham um papel em doenças complexas como o COVID, e saber quais são é importante para prever como diferentes pessoas serão afetadas. No início da pandemia, ser mais velho, com excesso de peso ou fumar foram identificados como aumentando o risco de desenvolver COVID grave. Isso então informou as decisões …
Continue lendo “Estudo encontra proteínas do sangue que podem aumentar o risco de COVID grave”
