Encontrar a história de origem do SARS-CoV-2, o coronavírus responsável por quase 3,9 milhões de mortes em todo o mundo, foi em grande parte dificultado pela falta de acesso às informações da China, onde os primeiros casos surgiram.
Agora, um pesquisador em Seattle desenterrou arquivos excluídos do Google Cloud que revelam 13 sequências genéticas parciais para alguns dos primeiros casos de COVID-19 em Wuhan, Carl Zimmer relatou para o The New York Times.
As sequências não inclinam a balança em direção a ou se afastando de uma das muitas teorias sobre como o SARS-CoV-2 surgiu – elas não sugerem que o vírus vazou de um laboratório de alta segurança em Wuhan, nem sugerem um vírus natural evento de transbordamento. Mas eles confirmam a ideia de que o novo coronavírus estava circulando antes do primeiro grande surto em um mercado de frutos do mar.
Para determinar exatamente como e onde o vírus se originou, os cientistas precisam encontrar o chamado vírus progenitor, aquele do qual todas as outras cepas descendem. Até agora, as primeiras sequências são principalmente aquelas amostradas de casos no Huanan Seafood Market em Wuhan, que foi inicialmente considerado onde o novo coronavírus emergiu no final de dezembro de 2019. No entanto, casos desde o início de dezembro e já em Novembro de 2019 não tinha vínculos com o mercado, indicando bem no início da pandemia que o vírus emergiu de outro local.
Havia um problema persistente com aquelas primeiras sequências genéticas. Os casos encontrados no mercado incluem três mutações que estão faltando nas amostras de vírus de casos que surgiram semanas depois fora do mercado. Os vírus sem essas três mutações eram mais parecidos com os coronavírus encontrados em morcegos-ferradura. Os cientistas estão relativamente certos de que o novo coronavírus de alguma forma emergiu dos morcegos, então é lógico supor que o progenitor também não teria essas mutações.
E agora, Jesse Bloom, do Howard Hughes Medical Institute, em Seattle, descobriu que as sequências deletadas – provavelmente algumas das primeiras amostras – também estavam desprovidas dessas mutações. (Bloom é o autor principal em uma carta publicada em maio na revista Science solicitando uma investigação imparcial sobre as origens do coronavírus, relatou a Live Science.)
“Eles são três etapas mais semelhantes aos coronavírus do morcego do que os vírus do mercado de peixes de Huanan”, disse Bloom ao The New York Times. Esses novos dados indicam que o vírus estava circulando em Wuhan bem antes de aparecer no mercado de frutos do mar, disse Bloom.
“Este fato sugere que as sequências de mercado, que são o foco principal da epidemiologia genômica no relatório conjunto da OMS-China … não são representativas dos vírus que estavam circulando em Wuhan no final de dezembro de 2019 e início de janeiro de 2020, “Bloom escreveu em seu artigo carregado em 22 de junho para o banco de dados de pré-impressão bioRxiv.
De acordo com Zimmer, há cerca de um ano, 241 sequências genéticas de pacientes com coronavírus desapareceram de um banco de dados online chamado Sequence Read Archive, mantido pelo National Institutes of Health (NIH).
Bloom percebeu as sequências ausentes quando encontrou uma planilha em um estudo publicado em maio de 2020 na revista PeerJ, no qual os autores listam 241 sequências genéticas de SARS-CoV-2 até o final de março de 2020; as sequências faziam parte de um projeto da Universidade de Wuhan chamado PRJNA612766 e foram supostamente carregadas no Arquivo de leitura de sequências. Ele procurou as sequências no banco de dados do arquivo e recebeu a mensagem “Nenhum item encontrado”, escreveu Bloom no artigo bioRxiv, que não foi revisado por especialistas.
Sua investigação revelou que as sequências excluídas foram coletadas por Aisu Fu e Renmin Hospital da Universidade de Wuhan, e uma pré-impressão da pesquisa publicada a partir dessas sequências (referida como Wang et al. 2020) sugeriu que vieram de amostras de esfregaço nasal de pacientes ambulatoriais suspeitou de COVID-19 no início da epidemia.
Bloom não conseguiu encontrar nenhuma explicação para o motivo pelo qual as sequências foram excluídas, e seus e-mails para os dois autores correspondentes não receberam resposta.
“Não há razão científica plausível para a exclusão: as sequências são perfeitamente concordantes com as amostras descritas em Wang et al. (2020a, b)”, escreveu Bloom em bioRxiv. “Não há correções no artigo, o artigo afirma que a aprovação de seres humanos foi obtida e o sequenciamento não mostra evidências de contaminação de plasmídeo ou amostra a amostra. Portanto, parece provável que as sequências foram deletadas para obscurecer sua existência.”
Bloom observa várias limitações de seu estudo, principalmente que as sequências são apenas parciais e não incluem nenhuma informação para dar uma data clara ou local de coleta – informações cruciais para rastrear o vírus de volta à sua origem.
Independentemente disso, Bloom pensa que olhar mais profundamente para os dados arquivados do NIH e outras organizações – e juntar as sequências – poderia ajudar a pintar um quadro mais claro da origem e da propagação inicial do SARS-CoV-2, tudo sem a necessidade de estudos de base na China.
Publicado em 27/06/2021 07h56
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