No esforço para desenvolver melhores tratamentos contra o câncer e trabalhar em direção a uma cura potencial para esta doença insidiosa, o estudo de células cancerosas cultivadas em pratos de cultura é crucial – mas novas pesquisas destacam algumas diferenças genéticas importantes entre essas células e as células cancerosas que crescem o corpo humano.
Embora isso não signifique que a pesquisa de laboratório usando células cultivadas em laboratório não possa ser útil e informativa, é importante que os cientistas saibam quais são essas diferenças enquanto procuram maneiras de impedir que os tumores se espalhem e causem danos.
Os pesquisadores desenvolveram um modelo de aprendizado de máquina chamado CancerCellNet (CCN) para comparar células cancerosas no corpo com células cancerosas de quatro outras fontes: 26 modelos de camundongos projetados para desenvolver câncer; 415 camundongos com células cancerosas humanas transplantadas (xenoenxertos); 131 bolas de tecido 3D cultivadas em um laboratório para imitar tumores (tumoróides); e 657 linhas de células cancerosas tradicionais (células cancerosas cultivadas em pratos de cultura).
Ao comparar as sequências de RNA dessas células – as instruções biológicas que determinam como as proteínas se desenvolvem – com um banco de dados do genoma do câncer, a equipe foi capaz de descobrir como eles eram semelhantes aos cânceres in vivo em nível genético.
“Pode não ser uma surpresa para os cientistas que as linhas de células cancerosas são geneticamente inferiores a outros modelos, mas ficamos surpresos que os ratos e tumoróides geneticamente modificados tiveram um desempenho tão bom em comparação”, disse o biólogo molecular e geneticista Patrick Cahan, da Universidade Johns Hopkins.
Em média, os camundongos e tumoróides geneticamente modificados tinham sequências de RNA que mais se aproximavam do câncer humano real em cerca de 80% dos tipos de tumor testados, incluindo câncer de mama, pulmão e ovário.
As linhagens de células cancerosas não se saíram tão bem, com mais discrepâncias para os tumores humanos registrados. Em um exemplo mencionado no estudo, uma linha celular conhecida como PC3 para câncer de próstata, na verdade, se assemelhava mais ao câncer de bexiga. Parece que as linhas celulares começam a mudar assim que saem de seu ambiente natural.
“O RNA é um substituto muito bom para o tipo de célula e identidade celular, que são fundamentais para determinar se as células desenvolvidas em laboratório se parecem com suas contrapartes humanas”, disse Cahan.
“Os dados de expressão de RNA são muito padronizados e disponíveis para os pesquisadores, e menos sujeitos a variações técnicas que podem confundir os resultados de um estudo.”
Os benefícios do CancerCellNet são que ele é versátil e rápido: é certamente mais rápido e menos caro do que o transplante de câncer em camundongos para ver como eles se desenvolvem, que é um dos métodos que os cientistas usam atualmente para comparar diferentes modelos.
Existem limitações no estudo a serem consideradas. Por melhor que o RNA seja uma forma de comparar células, ele não conta toda a história, e os pesquisadores querem adicionar mais dados ao seu banco de dados de treinamento CCN para torná-lo mais preciso.
Além disso, não vale a pena que o estudo também tenha analisado relativamente poucos modelos de camundongos e tumoróides projetados, o que pode ter distorcido um pouco os resultados.
Embora este seja apenas o começo para o CCN, mostra-se bastante promissor em ser capaz de ajudar os pesquisadores a descobrir o quão realistas são seus modelos de câncer – e quão confiáveis os estudos baseados neles serão quando se trata de transformá-los em tratamentos reais . Além do mais, ele também pode ser facilmente adaptado para futuros modelos de câncer.
“Como o CCN é de código aberto e fácil de usar, ele pode ser aplicado prontamente a modelos de câncer recém-gerados como um meio de avaliar sua fidelidade”, explicam os pesquisadores em seu artigo.
Publicado em 26/06/2021 09h23
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