Um estudo liderado pela SickKids sequenciou todo o genoma de mais de 11.000 indivíduos, fornecendo novos insights sobre os fatores genéticos associados ao transtorno do espectro autista.
Os pesquisadores do Hospital for Sick Children (SickKids) revelaram novos genes e alterações genéticas relacionadas ao transtorno do espectro do autismo (TEA) na mais abrangente análise de sequenciamento do genoma completo do autismo até o momento, melhorando nossa compreensão da base genômica do TEA.
A pesquisa, publicada na Cell, utilizou todo o sequenciamento do genoma para analisar os genomas inteiros de mais de 7.000 indivíduos com autismo e mais 13.000 irmãos e familiares. O estudo encontrou 134 genes conectados ao TEA e identificou uma série de alterações genéticas, particularmente variações no número de cópias de genes, que provavelmente estão ligadas ao autismo, incluindo variantes raras associadas ao TEA presentes em cerca de 14% dos participantes com autismo.
A maioria dos dados foi extraída do banco de dados Autism Speaks MSSNG, o maior conjunto de dados do genoma completo do autismo do mundo, que fornece aos pesquisadores do autismo acesso livre e aberto a milhares de genomas sequenciados.
“Ao sequenciar todo o genoma de todos os participantes e com profundo envolvimento das famílias participantes no MSSNG na formação de nossas prioridades de pesquisa, maximizamos o potencial de descoberta e permitimos análises que abrangem todos os tipos de variantes, desde as menores alterações de DNA até aquelas que afetam cromossomos inteiros”, diz o Dr. Stephen Scherer, cientista sênior, genética e biologia do genoma e chefe de pesquisa da SickKids e diretor do McLaughlin Center da Universidade de Toronto.
O Dr. Brett Trost, principal autor do artigo e pesquisador associado no programa de Genética e Biologia do Genoma da SickKids, observa que o uso do WGS permitiu que os pesquisadores descobrissem tipos de variantes que, de outra forma, não seriam detectáveis. Esses tipos variantes incluem rearranjos complexos de DNA, bem como expansões repetidas em tandem, uma descoberta apoiada por pesquisas recentes do SickKids sobre a ligação entre autismo e segmentos de DNA que são repetidos muitas vezes. O papel do DNA mitocondrial herdado da mãe também foi examinado no estudo e considerado responsável por 2% do autismo.
O artigo também aponta nuances importantes na genética do autismo em famílias com apenas um indivíduo com autismo em comparação com famílias que têm vários indivíduos com autismo, conhecidas como famílias multiplex. Surpreendente para a equipe foi que a “pontuação poligênica” – uma estimativa da probabilidade de um indivíduo ter autismo, calculada pela agregação dos efeitos de milhares de variantes comuns em todo o genoma – não foi maior entre as famílias multiplex.
“Isso sugere que o autismo em famílias multiplex pode ser mais provável de estar ligado a variantes raras e altamente impactantes herdadas de um dos pais. Como os traços genéticos e clínicos associados ao autismo são tão complexos e variados, grandes conjuntos de dados como os que usamos são essenciais para fornecer aos pesquisadores uma compreensão mais clara da arquitetura genética do autismo”, diz Trost.
A equipe de pesquisa diz que os dados do estudo podem ajudar expandindo as investigações sobre a variedade de variantes que podem estar ligadas ao TEA, bem como os esforços para entender melhor os contribuintes para os 85% de indivíduos autistas para os quais a causa genética permanece sem solução. Em um estudo vinculado de 325 famílias com TEA de Newfoundland publicado na Nature Communications, a equipe do Dr. Scherer descobriu que combinações de fatores genéticos espontâneos, hereditários raros e poligênicos reunidos no mesmo indivíduo podem potencialmente levar a diferentes subtipos de autismo.
A Dra. Suzanne Lewis, geneticista e investigadora do BC Children’s Hospital Research Institute, que diagnosticou muitas das famílias inscritas no estudo, disse: ASD. Esse rico conjunto de dados também oferece uma oportunidade de aprofundar o exame de outros fatores que podem determinar a chance de um indivíduo desenvolver essa condição complexa para ajudar a individualizar futuras abordagens de tratamento”.
Publicado em 16/01/2023 04h12
Artigo original:
- https://scitechdaily.com/worlds-largest-autism-study-uncovers-134-new-genes-linked-to-the-condition/
Estudo original: