Pesquisadores descobriram que certas células cancerígenas expressam genes responsáveis pela coagulação do sangue, que podem ser alvo de anticoagulantes no tratamento do câncer.
Pesquisadores do HSE descobriram genes específicos do subtipo mais agressivo de carcinoma renal de células claras. Grigory Puzanov, pesquisador do Laboratório Internacional de Bioinformática da Faculdade de Ciências da Computação da HSE, analisou dados de 456 pacientes com a doença e identificou subtipos de câncer que tinham um prognóstico favorável ou desfavorável. As descobertas foram publicadas na revista Scientific Reports.
Carcinoma renal de células claras (ccRCC) é o tipo mais comum de câncer renal. Nas últimas décadas, o número de novos casos tem aumentado. Embora haja uma quantidade significativa de dados sobre esta doença, ainda faltam informações sobre genes humanos específicos que possam ajudar a prever seu curso clínico.
As descobertas do estudo de Puzanov revelam quais subtipos de ccRCC são mais perigosos do que outros e quais genes humanos parecem ser responsáveis pela progressão da doença. Esta nova informação é significativa para a detecção precoce de tumores agressivos e para a elaboração de planos de tratamento personalizados para pacientes com ccRCC.
O autor analisou dados do The Cancer Genome Atlas (TCGA) em 456 amostras de tumores para os quais nenhuma radioterapia ou farmacoterapia adicional foi realizada. Subtipos com diferentes taxas de sobrevivência foram identificados usando o método k-means para agrupamento de amostras em subgrupos com características semelhantes. Para o agrupamento de genes, Puzanov selecionou 2.000 genes com padrões de expressão altamente variáveis no ccRCC.
A expressão gênica é o processo pelo qual um gene é lido e copiado para produzir um RNA mensageiro (mRNA) que é então usado para sintetizar proteínas.
Um algoritmo bioinformático foi executado 100 vezes, cada vez classificando as amostras de tumor com base na semelhança dos padrões de expressão dos 2.000 genes. Três clusters (subtipos) com diferentes taxas de sobrevivência foram identificados. O cluster com as menores taxas de sobrevivência foi associado a metástases e à pior resposta ao tratamento subsequente.
O estudo foi realizado em várias etapas. Na primeira fase, as características de cada cluster foram examinadas para uma melhor compreensão dos fatores genéticos que poderiam influenciar o curso da doença. Em seguida, o autor do estudo identificou os genes-chave específicos para clusters de alta e baixa sobrevivência e construiu uma rede de interações para proteínas cuja síntese é codificada por esses genes.
A análise de Puzanov determinou quais genes codificavam proteínas com o maior número de conexões de rede. O agrupamento com as taxas de sobrevivência mais baixas foi associado aos genes MFI2, CP, APOB e ENAM, conhecidos por estarem envolvidos no transporte do fator de crescimento semelhante à insulina (uma proteína semelhante em estrutura à insulina) e no pós-translacional modificação de proteínas. Além disso, específicos para o subtipo de baixa sobrevida foram os genes que codificam fibrinogênio e protrombina associados à coagulação sanguínea (FGA, FGG e F2).
“Alguns desses genes-chave podem afetar a eficácia das terapias antitumorais. Por exemplo, o aumento da atividade dos genes CP, FGA e FGG está associado a uma resposta ruim ao nivolumab, e a alta expressão de APOB e ENAM prediz uma falta de resposta ao sunitinib. Esse conhecimento pode ajudar a prescrever os tratamentos direcionados mais adequados para pacientes com doenças malignas” – Grigory Puzanov, Pesquisador, Laboratório Internacional de Bioinformática, Faculdade de Ciência da Computação, Universidade HSE
Segundo o pesquisador, o uso combinado de antitumorais convencionais e anticoagulantes (medicamentos que ajudam a prevenir coágulos sanguíneos) pode aumentar a eficácia do tratamento do câncer. Assim, há evidências de que a heparina, que é comumente usada para tratar eventos tromboembólicos em pacientes com câncer, contribui para a sobrevida do paciente e tem atividade antimetastática.
Publicado em 16/01/2023 05h01
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