doi.org/10.1101/2023.11.19.566520
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#Genoma
Os genomas completos de 500.000 pessoas no Biobanco do Reino Unido ajudarão os pesquisadores a investigar o nosso código genético em busca de ligações a doenças.
A maior coleção do mundo de genomas humanos completos acaba de ser lançada.
O UK Biobank – um repositório de dados de saúde, genómicos e outros dados biológicos – divulgou hoje sequências completas do genoma de cada um dos 500.000 voluntários britânicos na base de dados. Investigadores de todo o mundo podem solicitar acesso aos dados, que carecem de detalhes identificáveis, e utilizá-los para investigar a base genética da saúde e da doença.
“Os cientistas estão olhando para isso como o Google Maps”, disse Rory Collins, presidente-executivo do UK Biobank, em uma coletiva de imprensa. “Quando querem saber quais são os caminhos do estilo de vida, do ambiente, da genética até às doenças, não vão ao Google, vão ao UK Biobank.”
A bonança de hoje libera a sequência completa do genoma de 3 bilhões de letras para cada participante do Biobank do Reino Unido e segue a divulgação de 2021 de genomas inteiros de 200.000 participantes do Biobank. O esforço de 200 milhões de libras (250 milhões de dólares) foi financiado pelo financiador de investigação biomédica Wellcome, pelo governo do Reino Unido e por várias empresas farmacêuticas – que, em troca, tiveram acesso aos dados nove meses antes da sua divulgação mais ampla.
Anteriormente, a informação genética do UK Biobank incluía “exomas” inteiros – cada um sendo os 2% do genoma que codifica proteínas – e antes disso, 850.000 variantes comuns de DNA de uma única letra que estavam espalhadas por todo o genoma. Esta última informação alimenta estudos de associação genômica ampla (GWAS) que ligam saúde e genética.
Variantes raras
Mas quando os investigadores procuram associações entre genética e doenças ou outras características, a maioria destes “acertos” aparecem em regiões não codificantes do genoma que estão em falta nas sequências do exoma e são cobertas apenas em baixa resolução nos dados existentes do genoma. Genomas completos também permitem aos investigadores detectar mutações muito raras, que tendem a ter uma influência mais forte numa característica do que as variações comuns incluídas nos dados do genoma, diz Michael Weedon, geneticista humano da Universidade de Exeter, no Reino Unido. “Esperamos que variantes raras nos dêem mais informações sobre a biologia.”
Isso já está provando ser o caso. Numa pré-impressão de 20 de Novembro, uma equipe liderada por Weedon e Gareth Hawkes, um geneticista humano também em Exeter, extraiu os primeiros 200.000 genomas completos nos dados do Biobank do Reino Unido e encontrou 29 variantes raras de DNA que estavam implicadas em diferenças de altura tão grandes como 7 centímetros. ; essas variantes não foram detectadas em pesquisas genéticas anteriores. O estudo foi um piloto para analisar todos os 500 mil genomas, diz Weedon, que planeja passar o dia analisando pela primeira vez os dados do genoma.
Em última análise, os investigadores precisarão de muito mais de meio milhão de genomas completos para mapear de forma abrangente as associações entre variantes genéticas raras e a saúde, diz Weedon. “Eu consideraria isso um bom próximo passo para obter os milhões de amostras de que provavelmente precisaremos.”
Links de doenças
Esses números estão no horizonte. O estudo All of Us, financiado pelo governo dos EUA, planeia eventualmente divulgar dados completos do genoma e da saúde de um milhão ou mais de pessoas nos Estados Unidos. O esforço liberou 250 mil genomas, mas só começou a aceitar inscrições para estudar os dados de pesquisadores de fora dos EUA em agosto. Bancos de dados como o All of Us também serão úteis para confirmar ligações descobertas com o Biobank do Reino Unido, dizem os pesquisadores.
Com base no que foi aprendido com os primeiros 200.000 genomas do Biobanco do Reino Unido, Andrea Ganna, geneticista estatística da Universidade de Helsínquia, ainda não está convencida de que eles proporcionem uma boa relação custo-benefício. Muitas das variantes não codificantes detectadas por estudos de genoma completo, como os de Weedon e Hawkes, estão próximas dos resultados já encontrados através do GWAS. Ainda assim, sequências completas do genoma podem ajudar os pesquisadores a mapear as ligações das doenças com mais precisão às variações estruturais – pedaços de DNA ausentes, extras ou invertidos – diz Ganna.
O Biobank do Reino Unido já deu origem a mais de 9.000 publicações, e o verdadeiro impacto do último lançamento poderá não ser claro durante algum tempo, disse Collins. “Acho que ficaremos surpresos com a quantidade de coisas que nem imaginamos.”
Publicado em 17/12/2023 09h32
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