Documentos descrevem os métodos de edição de plantas CRISPR e melhorias no DNA-PAINT e algo mais

Edição de gentes CRISPR

Duas novas abordagens baseadas em CRISPR para edição de genoma em plantas são relatadas na Nature Plants esta semana.

O primeiro método, desenvolvido por cientistas da Universidade de Zhejiang, envolve a engenharia de um vetor baseado em vírus de RNA de cadeia negativa da planta para permitir a entrega sem DNA de uma cassete CRISPR-Cas9 completa nas plantas. A equipe usa sua técnica para obter deleções únicas e multiplexadas de mutagênese e cromossomo em alta frequência em um modelo de tabaco alotetraplóide modelo com efeitos mínimos ou fora do objetivo.

O segundo método foi desenvolvido por um grupo liderado pela Universidade de Helsinque e combina o CRISPR-Cas9 com um sistema indutível específico para o tipo de célula baseado em XVE, que permite que os genes-alvo sejam nocauteados de forma eficiente e condicional em qualquer estágio do desenvolvimento. Este sistema, escrevem os cientistas, “é adequado para rastrear alterações moleculares e celulares precoces antes que os fenótipos visíveis apareçam” e pode ser reaproveitado para edição de base ou regulação transcricional usando diferentes variantes do Cas9.

Modelos tradicionais de privacidade de dados de saúde fornecem proteção limitada para dados genômicos, necessitando de melhorias contínuas nas tecnologias de privacidade e nos regulamentos e diretrizes para esses dados, escreveram um par de pesquisadores da Universidade da Califórnia, em San Diego, na Nature Genetics esta semana.

Em seu artigo de revisão, a equipe fornece uma visão geral das principais ameaças à privacidade enfrentadas pela pesquisa genômica e discute os desafios de proteção de dados apresentados pelo emergente mercado de testes genéticos diretos ao consumidor.

Eles também oferecem técnicas básicas de proteção de privacidade para dados genômicos, destacando sua potencial aplicação em testes genéticos diretos ao consumidor e análises forenses, e discutem oportunidades para melhorar o design de abordagens de proteção de privacidade por meio do uso de novas tecnologias e iniciativas de privacidade para compartilhamento de dados.

DNA-Paint

Um método para acelerar a técnica de microscopia de super-resolução DNA-PAINT é apresentado na Nature Methods esta semana.

O DNA-PAINT envolve a marcação de pequenos pedaços de DNA com um corante fluorescente que se liga transitoriamente às fitas de DNA correspondentes ligadas a uma molécula alvo, resultando em um piscar de olhos que permite a microscopia estocástica de super-resolução. Apesar de seus benefícios, o DNA-PAINT é limitado pelas baixas velocidades de imagem que foram tratadas apenas parcialmente pelo design racional da sequência e pela otimização do buffer.

Para melhorar ainda mais a técnica, os cientistas da Universidade Ludwig Maximilian introduziram motivos de sequência de DNA periódicos concatenados que produzem amostras até 100 vezes mais rápidas do que o DNA-PAINT tradicional. Eles também estendem sua abordagem a seis motivos de sequência ortogonal, permitindo imagens multiplexadas com velocidade otimizada.


Publicado em 04/07/2020 07h17

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