A linhagem P.1 do SARS-CoV-2 provavelmente surgiu em Manaus, Brasil, em meados de novembro de 2020, de acordo com um novo estudo genômico e epidemiológico. Além disso, descobriu que a variante viral pode ser mais transmissível e a infecção prévia por SARS-CoV-2 pode fornecer proteção reduzida contra ela.
O Brasil foi particularmente atingido pela pandemia COVID-19, com 13,6 milhões de casos notificados e quase 360.000 mortes, de acordo com o Centro de Recursos do Coronavírus Johns Hopkins. Um estudo sugeriu que mais de 70 por cento da população de Manaus foi infectada com SARS-CoV-2 sete meses após a chegada do vírus lá.
Apesar do alto nível de infecção, a cidade experimentou outra onda de infecções por SARS-CoV-2 no final de 2020 e início de 2021. Conforme relatado na Science na quarta-feira, pesquisadores liderados por Ester Sabino, da Universidade de São Paulo, sequenciaram e analisaram amostras deste ressurgimento em Manaus para rastreá-lo de volta ao surgimento de uma nova variante de preocupação, apelidada de P.1.
“A vigilância genômica global aprimorada de variantes preocupantes, que podem exibir maior transmissibilidade e / ou evasão imunológica, é crítica para acelerar a capacidade de resposta à pandemia”, escreveram os pesquisadores em seu artigo.
Sabino e seus colegas sequenciaram isolados de SARS-CoV-2 de 184 amostras de pessoas que buscavam o teste COVID-19 em Manaus entre novembro e dezembro de 2020.
Com isso, eles descobriram a nova linhagem viral P.1 da SARS-CoV-2, que contém 17 alterações de aminoácidos, incluindo 10 que afetam a proteína do pico. Oito dessas mudanças que definem a linhagem estão sob seleção positiva diversificada e três – N501Y, K417T e E484K – estão no domínio de ligação ao receptor da proteína de pico. Os mesmos três resíduos estão alterados na variante B.1.351 de interesse e a alteração N501Y está presente na variante B.1.1.7, apontando para uma possível adaptação molecular convergente, eles notaram.
Uma análise filogenética descobriu que P.1 e outra linhagem chamada P.2 descendem da linhagem B.1.1.28 que foi descoberta pela primeira vez no Brasil em março de 2020. Uma análise mais aprofundada do relógio molecular rastreou o surgimento de P.1 até meados de novembro de 2020 Seu surgimento foi precedido por um período de evolução molecular mais rápida, que os pesquisadores apontaram também foi observado no surgimento da linhagem B.1.1.7 e hipotetizado ter ocorrido em um paciente imunocomprometido ou cronicamente infectado.
Além disso, o prazo estimado para o surgimento de P.1 é de cerca de três a quatro semanas antes de Manaus experimentar um aumento confirmado de casos de COVID-19.
Usando modelagem, os pesquisadores exploraram ainda se a nova onda de infecções foi devido ao aumento da gravidade ou transmissibilidade de P.1 ou ao declínio da imunidade anterior entre os pacientes. A análise deles apontou para diferenças entre as características epidemiológicas de P.1 e outras linhagens SARS-CoV-2, sugerindo que o ressurgimento viral em Manaus não é apenas devido ao declínio da imunidade.
Em particular, eles estimaram que P.1 é entre 1,7 vezes e 2,4 vezes mais transmissível do que as cepas não-P.1 e pode escapar entre 21% a 46% da imunidade induzida por infecções com cepas não-P.1.
Os pesquisadores também descobriram um aumento na mortalidade após o surgimento da variante P.1, mas disseram que não conseguiram distinguir se P.1 é mais mortal ou se o efeito foi devido ao estresse no sistema de saúde de Manaus, ou ambos.
Sabino e seus colegas observaram em seu artigo que a linhagem P.1 está se espalhando rapidamente pelo Brasil e foi encontrada em três dezenas de outros países. Eles acrescentaram que as estratégias de vigilância genômica viral são frequentemente inadequadas e que mais dados são necessários para estudar seu efeito.
“Esforços de vigilância genômica sustentáveis para rastrear a frequência das variantes juntamente com ferramentas analíticas para quantificar a dinâmica da linhagem e dados de vigilância epidemiológica anônimos podem permitir vigilância aprimorada em tempo real de variantes preocupantes em todo o mundo”, escreveram eles, acrescentando que os estudos que examinam “a eficácia da vacina no mundo real em resposta ao P.1 são urgentemente necessários. “
Publicado em 15/04/2021 11h42
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